计算机软件一般由著作权法予以保护，其侵权行为与一般的民事侵权行为相比，具有隐蔽性和侵权行为多样性等特点，原告一般难以获取被告侵权的直接证据。目前，法院在审理计算机软件侵权案时，在举证责任分配方面，多机械地使用“谁主张、谁举证”原则将举证责任分配给原告，而概念与其表达同一原则、反向工程等权利限制又加重了原告的举证责任，这往往带来对原告不利的审判结果。所以，法院如果机械地适用“谁主张、谁举证”这一规则来处理软件侵权案件，则无法有效保护软件权利人的合法权益。在计算机软件侵权案件中，根据不同的情况，可要求被告承担相应的举证责任：如被告是出版者、制作者、发行者、出租者等，则可采取举证责任倒置的方式来要求被告承担举证责任；对于其它类型的计算机软件侵权案件，在符合了一定条件后，可以采取举证责任转移的方式来要求被告承担举证责任，如果被告不承担这种转移的举证责任或举证不能，则可以依据经验法则直接推定被告侵权成立。